中國科學院北京基因組研究所（國家生物信息中心）標識是由抽象的“DNA”雙螺旋結構、“圓”、“中國科學院北京基因組研究所（國家生物信息中心）”中英文等元素所組成。抽象的“DNA”雙螺旋結構體現了北京基因組研究所的內涵及特性。螺旋結構突破圓，象征開拓創新、科技興所，加強基因組學前沿研究，引領國際、國內基因組學研究潮流。標識中的藍色，代表著大海、科技，體現研究所充滿朝氣和強大科技力量；綠色，象征生命、健康，體現研究所不斷探索生命的奧秘，取得更大成就。標識整體為“圓”，象征和諧、美好，寓意北京基因組研究所美好的明天。