獲獎時間	獲獎名稱	獲獎類別	獲獎等級
2002.9	中國超級雜交水稻基因組計劃	求是杰出科技成就獎	集體獎
2005.2	非典型肺炎冠狀病毒基因組測序及ELISA診斷試劑盒研究--北京市科技進步獎二等獎	北京市科技進步獎	二等獎
2005	鄧亞軍-海嘯項目	2005“北京十大杰出青年”	個人獎
2003	抗SARS研究	“中國科學院防治非典工作先進基層黨組織” 稱號	集體獎
2003	文潔-抗SARS研究	“中國科學院防治非典型肺炎工作優秀共產黨員”	個人獎
2003	汪建-抗SARS研究	“首都防治非典型肺炎工作先進個人”	個人獎
2003	SARS項目	首都勞動獎狀	集體獎
2003	中國科學院北京赴泰國-DNA檢測救援小組	首都勞動獎狀	集體獎
2005	楊煥明	第三世界科學院生物獎	個人獎