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    北京基因組所研發RNA甲基化7-甲基鳥嘌呤(m7G)測序技術

      7-甲基鳥嘌呤(m7G)修飾是轉錄后調控中最常見的堿基修飾形式之一,廣泛分布于tRNArRNA、以及真核生物mRNA5’帽子區,對維持RNA的加工代謝、穩定、出核以及蛋白質翻譯具有重要作用。近期研究表明高等真核生物mRNA內部也含有m7G修飾,然而對其分布特征和調控作用目前尚不清楚。 

      中國科學院北京基因組研究所楊運桂團隊開發了單堿基分辨率的m7G高通量測序技術(m7G miCLIP-seq),通過該方法系統性描繪m7G在真核生物mRNA內部的分布特征,并進一步解析應激處理下該修飾對蛋白質翻譯的分子調控機制。相關研究成果在913日以Dynamic methylome of internal mRNA N7-methylguanosine and its regulatory role in translation為題在線發表于Cell Research雜志。 

      研究團隊通過繪制真核生物mRNA內部的m7G分布圖譜,發現該修飾的分布具有物種保守性。正常條件下,人和小鼠mRNA內部的m7G顯著富集于5’非翻譯區(5’UTR)尤其是翻譯起始位點附近的AG二堿基富集區;而H2O2和熱激處理下,m7G分布發生動態性變化,顯著富集于基因編碼區(CDS)和3’UTR區。結合Ribosome profiling數據發現,應激處理下形成的m7G具有促進蛋白質翻譯的作用;進一步結合minigene報告系統證實,H2O2處理下PCNA 3’UTR上的m7G修飾能夠增強該基因的翻譯效率。進一步通過western blot實驗證實,應激處理下,已知的m7G甲基轉移酶METTL1的蛋白水平顯著增加,說明應激處理下METTL1可能參與調控真核生物mRNA內部的m7G形成。 

      該研究通過開發單堿基分辨率的m7G高通量測序技術,成功繪制了高等真核生物mRNA內部的m7G動態分布圖,并揭示了應激處理下m7G對蛋白質翻譯的分子調控機制,為后續m7G的功能性研究提供基本的技術和理論支撐該研究得到了中國科學院戰略性先導科技專項、國家自然科學以及國家重點研發計劃等基金資助。 

       mRNA內部m7G的高通量測序技術及對mRNA翻譯調控機制

      論文鏈接 

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